1858 م عين عضوا في مجلس المحاسبة المالية « 6 » ، ثم عضوا في مجلس وإلا ( الأحكام العدلية ) « 7 » ، وبعدها انتقل إلى المشيخة . مشيخته : بعد وفاة شيخ الإسلام السابق محمد عارف أفندي ، عين المولى محمد سعد الدين أفندي في منصب شيخ الإسلام ومفتي الدولة العثمانية ، وذلك في 21 جمادى الأولى 1275 ه - 27 تشرين الثاني 1858 م وكان هو شيخ الإسلام الأخير في عهد السلطان عبد المجيد ( 1255 - 1277 ه - 1839 - 1861 م ، حيث استمر في المشيخة في عهد السلطان الجديد عبد العزيز واستمر في هذا المنصب حتى 11 جمادى الآخرة 1280 ه - 23 تشرين الثاني 1863 م ، حيث تم عزله وأحيل على المعاش ، وعين خلفا له في المشيخة عمر حسام الدين أفندي ، وكانت دفعته ( 146 ) في عهدي السلطانين عبد المجيد وعبد العزيز ، وكانت مدته في المشيخة ( 5 سنوات و 20 يوما هجرية ) - ( 4 سنوات و 10 شهور و 26 يوما ميلادية ) . وفاته : بعد عزله من المشيخة ، انقطع المولى محمد سعد الدين أفندي للعبادة في منزله ، وبقي كذلك حتى وفاته في استانبول في 23 ربيع الأول 1283 ه - 6 آب 1866 م ، ودفن في اسكدار ، قرب تربه قره‌جه أحمد ، وتروي عنه المصادر بأنه كان صاحب عدالة ومستقيما ومقتدرا ، وصاحب بعض الآثار الخيرية من بينها منبر جامع الشيخ عمر أفندي « 8 »

--> ( 6 ) - مجلس المحاسبة المالية : وهو مجلس للتدقيق المالي ، يشبه في مصطلحتنا ( ديوان المحاسبة ) وقد شكل هذا المجلس ، في القرب 13 ه - 19 م ، بهدف التدقيق في حسابات الواردات ، والمنفقات ، وة الالمانات ، ونالسلطان ، والتسويات المالية ، وبيع الأراضي الأميرية وتأجيرها ، والأرقاف وحساباتها ، وخلاصة القول بأن ، عمل هذا المجلس يقوم بالتدقيق في كافة ما يدخل للخزانه العثمانية ، وما يخرج فيها انظر : علمية سالنامه س ، ص 593 ، سالنامه دولت علية عثمانية ، دفعة ( 12 ) لسنة 1274 ه ، ص 280 ، معجم الدولة العثمانية ، ص 285 . ( 7 ) - لقد سبق الحديث عن هذا المجلس والتعريف به ، وتذكر المصادر بأنه عين عضوا في مجلس وإلا ( الأحكام العدلية ) ، في صفر 1275 ه - أيلول 1858 م ، كما ذكر : سجل عثماني ، ج 3 ، ص 20 . ( 8 ) - جامع الشيخ عمر أفندي : لم تعثر على اية معلومات حول هذا الجامع